“If people do not believe that mathematics is simple, it is only because they do not realize how complicated life is.”
– 冯·诺依曼(John von Neumann)
eMD软件培训
中科院理论物理所培训报告
报告由中国科学院理论物理研究所主办,属理论物理先进计算平台系列培训。
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第一讲 分子动力学与eMD软件
报告人:徐顺
主要内容:分子动力学基本原理、分子动力学模拟三款主流软件的特征、eMD软件应用简介。
报告时间:2020年9月9日
视频链接: 分子动力学与eMD软件 -
第二讲 GPU异构计算加速eMD
报告人:徐顺
主要内容:GPU异构计算概要、分子动力学使用GPU加速的一般方式,eMD软件中GPU计算加速的模块设计与演示。
报告时间:2020年12月30日
视频链接: GPU异构计算加速eMD分子动力学模拟
中国科学院大学培训报告
受中国科学院大学周昕教授邀请,介绍eMD的设计和基本使用。
- 第一讲 eMD设计概要与使用简介
报告人:徐顺
主要内容:分子动力学模拟软件现状趋势,eMD软件设计导向和软件架构,并结合实例展示eMD在各种分子力场下的建模应用和GPU计算加速效果。
报告时间:2021年1月19日
参见:海报 - 第二讲 eMD的Tcl与Python扩展使用介绍
报告人:徐顺
主要内容:分子动力学基本原理、分子动力学模拟三款主流软件的特征、eMD软件应用简介。
报告时间:2021年1月21日
参见:海报
中国院寒旱所培训报告
受北京超级云计算中心邀请,在中国科学院寒区旱区环境与工程研究所介绍分子模拟方法和eMD软件。
- 分子动力学模拟方法与软件:从LAMMPS、GROMACS到eMD
报告人:徐顺
主要内容:介绍广义系综增强抽样方法在研究分子体系相变过程的显著优势,及其在水相变过程研究中的作用;以对比分析现有分子动力学模拟软件LAMMPS和GROMACS的方式,介绍自主研发的eMD分子动力学模拟软件的设计概要和应用特征。
报告时间:2021年3月17日
参见:海报
最后修改: 2024年9月7日,